Ateneumin kokoelmia pidetään yleisön nähtävänä museon kolmannessa kerroksessa.

Ateneumin kokoelmanäyttelyssä esitellään laajempina kokonaisuuksina mm. Akseli Gallen-Kallela ja Hugo Simberg. Simberg-kabinetissa on mahdollisuus nähdä Simbergin harvoin esillä olleita guassi- ja vesivärimaalauksia. Tarkoin säädetyt valaistusolosuhteet mahdollistavat näiden valonarkojen teosten esittelyn osana kokoelmanäyttelyä nyt ensimmäistä kertaa. Valonarkoja teoksia esittelee myös vuonna 2009 avattu ukiyo-e-kabinetti, Ateneumin japanilaisten puupiirrosten kokoelman oma sali.

FOKUS-otsikon alla nähdään pienempiä, salikohtaisia näyttelykokonaisuuksia. Niissä syvennytään lähemmin johonkin Ateneumin taidemuseon teokseen, taiteilijaan tai aihepiiriin.
Kokoelmanäyttelyn tietoseinä kertoo Ateneumin kokoelmista ja Ateneumin toiminnasta taidelaitoksena.

Kansallisgallerian asema velvoittaa Ateneumin taidemuseota lainaamaan teoksiaan muihin museoihin Suomessa ja ulkomailla, ja mm. tästä syystä kokoelmien esillepano museosaleissa vaihtelee jonkin verran. Mikäli haluat tietää, onko jokin tietty teos museossa esillä, ole hyvä ja käytä yllä olevaa hakutoimintoa (kenttä Ateneumin yhteystietojen alapuolella).